Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPUSD2Q8IZ73 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms