Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TREML1Q86YW5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TREML1Q86YW5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms