Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
STRCQ7RTU9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
STRCQ7RTU9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
STRCQ7RTU9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
STRCQ7RTU9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms