Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BHLHA9Q7RTU4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BHLHA9Q7RTU4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BHLHA9Q7RTU4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms