Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGAP27Q6ZUM4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGAP27Q6ZUM4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGAP27Q6ZUM4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGAP27Q6ZUM4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGAP27Q6ZUM4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGAP27Q6ZUM4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGAP27Q6ZUM4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGAP27Q6ZUM4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGAP27Q6ZUM4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGAP27Q6ZUM4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGAP27Q6ZUM4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGAP27Q6ZUM4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGAP27Q6ZUM4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGAP27Q6ZUM4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGAP27Q6ZUM4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGAP27Q6ZUM4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGAP27Q6ZUM4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARHGAP27Q6ZUM4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGAP27Q6ZUM4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARHGAP27Q6ZUM4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARHGAP27Q6ZUM4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP27Q6ZUM4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP27Q6ZUM4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms