Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LIAT1Q6ZQX7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LIAT1Q6ZQX7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LIAT1Q6ZQX7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LIAT1Q6ZQX7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LIAT1Q6ZQX7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LIAT1Q6ZQX7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LIAT1Q6ZQX7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LIAT1Q6ZQX7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms