Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPTNQ6XPR3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms