Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED27Q6P2C8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED27Q6P2C8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms