Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP4R4Q6NUP7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP4R4Q6NUP7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms