Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRAGBQ5VZM2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRAGBQ5VZM2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRAGBQ5VZM2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms