Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHYHD1Q5SRE7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms