Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WASHC2DQ5SRD0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WASHC2DQ5SRD0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC2DQ5SRD0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms