Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NOM1Q5C9Z4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOM1Q5C9Z4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms