Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TNNI3KQ59H18 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNI3KQ59H18 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNI3KQ59H18 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms