Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
AP5B1Q2VPB7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP5B1Q2VPB7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms