Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTF1Q16619 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms