Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXT1Q16394 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXT1Q16394 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXT1Q16394 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXT1Q16394 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXT1Q16394 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXT1Q16394 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXT1Q16394 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
EXT1Q16394 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXT1Q16394 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXT1Q16394 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EXT1Q16394 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EXT1Q16394 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXT1Q16394 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EXT1Q16394 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXT1Q16394 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EXT1Q16394 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXT1Q16394 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXT1Q16394 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXT1Q16394 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXT1Q16394 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EXT1Q16394 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EXT1Q16394 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EXT1Q16394 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXT1Q16394 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EXT1Q16394 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EXT1Q16394 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXT1Q16394 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EXT1Q16394 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXT1Q16394 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXT1Q16394 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXT1Q16394 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXT1Q16394 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXT1Q16394 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXT1Q16394 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXT1Q16394 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXT1Q16394 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EXT1Q16394 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EXT1Q16394 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXT1Q16394 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXT1Q16394 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EXT1Q16394 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EXT1Q16394 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EXT1Q16394 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EXT1Q16394 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXT1Q16394 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXT1Q16394 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EXT1Q16394 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EXT1Q16394 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EXT1Q16394 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EXT1Q16394 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXT1Q16394 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXT1Q16394 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXT1Q16394 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXT1Q16394 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXT1Q16394 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXT1Q16394 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXT1Q16394 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EXT1Q16394 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXT1Q16394 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXT1Q16394 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXT1Q16394 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EXT1Q16394 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXT1Q16394 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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EXT1Q16394 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EXT1Q16394 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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