Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NECTIN1Q15223 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NECTIN1Q15223 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NECTIN1Q15223 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
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