Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HSPB3Q12988 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HSPB3Q12988 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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