Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 GIP2YER054C 1647 nt4.39□□□□□ -1.71
USB1Q12208 CTS1YLR286C 1689 nt4.39□□□□□ -1.71
USB1Q12208 YGR122WYGR122W 1209 nt4.39□□□□□ -1.71
USB1Q12208 GTO1YGR154C 1071 nt4.39□□□□□ -1.71
USB1Q12208 SPL2YHR136C 447 nt4.39□□□□□ -1.71
USB1Q12208 ERG3YLR056W 1098 nt4.39□□□□□ -1.71
USB1Q12208 YJR015WYJR015W 1533 nt4.39□□□□□ -1.71
USB1Q12208 APJ1YNL077W 1587 nt4.39□□□□□ -1.71
USB1Q12208 LEU1YGL009C 2340 nt4.39□□□□□ -1.71
USB1Q12208 RFT1YBL020W 1725 nt4.38□□□□□ -1.71
USB1Q12208 ASP1YDR321W 1146 nt4.38□□□□□ -1.71
USB1Q12208 YFR035CYFR035C 345 nt4.38□□□□□ -1.71
USB1Q12208 SCW10YMR305C 1170 nt4.38□□□□□ -1.71
USB1Q12208 ETR1YBR026C 1143 nt4.38□□□□□ -1.71
USB1Q12208 YTA6YPL074W 2265 nt4.38□□□□□ -1.71
USB1Q12208 MGS1YNL218W 1764 nt4.37□□□□□ -1.71
USB1Q12208 SLT2YHR030C 1455 nt4.37□□□□□ -1.71
USB1Q12208 BIT2YBR270C 1638 nt4.37□□□□□ -1.71
USB1Q12208 SUA5YGL169W 1281 nt4.37□□□□□ -1.71
USB1Q12208 NIT2YJL126W 924 nt4.37□□□□□ -1.71
USB1Q12208 MID2YLR332W 1131 nt4.37□□□□□ -1.71
USB1Q12208 MRL1YPR079W 1146 nt4.37□□□□□ -1.71
USB1Q12208 YJR124CYJR124C 1347 nt4.37□□□□□ -1.71
USB1Q12208 CUE2YKL090W 1332 nt4.37□□□□□ -1.71
USB1Q12208 THP1YOL072W 1368 nt4.37□□□□□ -1.71
USB1Q12208 ABF1YKL112W 2196 nt4.36□□□□□ -1.71
USB1Q12208 FUN19YAL034C 1242 nt4.36□□□□□ -1.71
USB1Q12208 SFT2YBL102W 648 nt4.36□□□□□ -1.71
USB1Q12208 DCI1YOR180C 816 nt4.36□□□□□ -1.71
USB1Q12208 BBP1YPL255W 1158 nt4.36□□□□□ -1.71
USB1Q12208 HSP26YBR072W 645 nt4.36□□□□□ -1.71
USB1Q12208 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt4.36□□□□□ -1.71
USB1Q12208 NDC1YML031W 1968 nt4.36□□□□□ -1.71
USB1Q12208 DOA1YKL213C 2148 nt4.36□□□□□ -1.71
USB1Q12208 VID30YGL227W 2877 nt4.35□□□□□ -1.71
USB1Q12208 GAT4YIR013C 366 nt4.35□□□□□ -1.71
USB1Q12208 PNP1YLR209C 936 nt4.35□□□□□ -1.71
USB1Q12208 FRE3YOR381W 2136 nt4.35□□□□□ -1.71
USB1Q12208 MRI1YPR118W 1236 nt4.35□□□□□ -1.71
USB1Q12208 TSL1YML100W 3297 nt4.35□□□□□ -1.71
USB1Q12208 PRR1YKL116C 1557 nt4.35□□□□□ -1.71
USB1Q12208 DAL81YIR023W 2913 nt4.35□□□□□ -1.71
USB1Q12208 NUP116YMR047C 3342 nt4.34□□□□□ -1.71
USB1Q12208 REV7YIL139C 738 nt4.34□□□□□ -1.71
USB1Q12208 KRE9YJL174W 831 nt4.34□□□□□ -1.71
USB1Q12208 KTI12YKL110C 942 nt4.34□□□□□ -1.71
USB1Q12208 ECM1YAL059W 639 nt4.34□□□□□ -1.71
USB1Q12208 ETT1YOR051C 1239 nt4.34□□□□□ -1.71
USB1Q12208 COX11YPL132W 903 nt4.34□□□□□ -1.71
USB1Q12208 HXT14YNL318C 1623 nt4.34□□□□□ -1.71
USB1Q12208 FUI1YBL042C 1920 nt4.34□□□□□ -1.71
USB1Q12208 FPK1YNR047W 2682 nt4.34□□□□□ -1.72
USB1Q12208 SRV2YNL138W 1581 nt4.33□□□□□ -1.72
USB1Q12208 ADE4YMR300C 1533 nt4.33□□□□□ -1.72
USB1Q12208 AAD4YDL243C 990 nt4.33□□□□□ -1.72
USB1Q12208 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt4.33□□□□□ -1.72
USB1Q12208 LDB18YLL049W 540 nt4.33□□□□□ -1.72
USB1Q12208 SFI1YLL003W 2841 nt4.32□□□□□ -1.72
USB1Q12208 HIR2YOR038C 2628 nt4.32□□□□□ -1.72
USB1Q12208 PCL8YPL219W 1479 nt4.32□□□□□ -1.72
USB1Q12208 ATG23YLR431C 1362 nt4.32□□□□□ -1.72
USB1Q12208 TFG1YGR186W 2208 nt4.32□□□□□ -1.72
USB1Q12208 YGR016WYGR016W 573 nt4.32□□□□□ -1.72
USB1Q12208 ADD37YMR184W 597 nt4.32□□□□□ -1.72
USB1Q12208 RPL3YOR063W 1164 nt4.32□□□□□ -1.72
USB1Q12208 SSO1YPL232W 873 nt4.32□□□□□ -1.72
USB1Q12208 STE12YHR084W 2067 nt4.32□□□□□ -1.72
USB1Q12208 SIS2YKR072C 1689 nt4.32□□□□□ -1.72
USB1Q12208 PCA1YBR295W 3651 nt4.32□□□□□ -1.72
USB1Q12208 MSE1YOL033W 1611 nt4.32□□□□□ -1.72
USB1Q12208 ALG2YGL065C 1512 nt4.31□□□□□ -1.72
USB1Q12208 ASA1YPR085C 1332 nt4.31□□□□□ -1.72
USB1Q12208 MHF2YDL160C-A 243 nt4.31□□□□□ -1.72
USB1Q12208 PEX7YDR142C 1128 nt4.31□□□□□ -1.72
USB1Q12208 SUR2YDR297W 1050 nt4.31□□□□□ -1.72
USB1Q12208 SLD7YOR060C 774 nt4.31□□□□□ -1.72
USB1Q12208 SMA1YPL027W 738 nt4.31□□□□□ -1.72
USB1Q12208 NSG1YHR133C 876 nt4.3□□□□□ -1.72
USB1Q12208 SPG4YMR107W 348 nt4.3□□□□□ -1.72
USB1Q12208 HLJ1YMR161W 675 nt4.3□□□□□ -1.72
USB1Q12208 SPS18YNL204C 903 nt4.3□□□□□ -1.72
USB1Q12208 PDI1YCL043C 1569 nt4.3□□□□□ -1.72
USB1Q12208 BRE2YLR015W 1518 nt4.3□□□□□ -1.72
USB1Q12208 APM4YOL062C 1476 nt4.3□□□□□ -1.72
USB1Q12208 TGL4YKR089C 2733 nt4.3□□□□□ -1.72
USB1Q12208 KCC4YCL024W 3114 nt4.29□□□□□ -1.72
USB1Q12208 YDR134CYDR134C 411 nt4.29□□□□□ -1.72
USB1Q12208 SEH1YGL100W 1050 nt4.29□□□□□ -1.72
USB1Q12208 TPO2YGR138C 1845 nt4.29□□□□□ -1.72
USB1Q12208 RAD16YBR114W 2373 nt4.28□□□□□ -1.72
USB1Q12208 YDL121CYDL121C 450 nt4.28□□□□□ -1.72
USB1Q12208 GLE2YER107C 1098 nt4.28□□□□□ -1.72
USB1Q12208 TRX2YGR209C 315 nt4.28□□□□□ -1.72
USB1Q12208 ECM2YBR065C 1095 nt4.28□□□□□ -1.72
USB1Q12208 PHO90YJL198W 2646 nt4.28□□□□□ -1.72
USB1Q12208 APM2YHL019C 1818 nt4.28□□□□□ -1.72
USB1Q12208 MOT2YER068W 1764 nt4.27□□□□□ -1.73
USB1Q12208 RPL28YGL103W 450 nt4.27□□□□□ -1.73
USB1Q12208 PUS6YGR169C 1215 nt4.27□□□□□ -1.73
USB1Q12208 RPB4YJL140W 666 nt4.27□□□□□ -1.73
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