Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNA1Q09470 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA1Q09470 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNA1Q09470 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms