Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBBP4Q09028 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms