Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK5Q00535 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDK5Q00535 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms