Protein–RNA interactions for Protein: P61978

HNRNPK, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPKP61978 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.926e-9■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 CHPT1-210ENST00000552351 1524 ntTSL 226.87■■□□□ 1.896e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.756e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 CHPT1-204ENST00000549128 1552 ntTSL 525.98■■□□□ 1.756e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.656e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 TSC2-208ENST00000461648 1071 ntTSL 225.23■■□□□ 1.636e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.476e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 KIF13B-204ENST00000523130 1267 ntTSL 520.88■□□□□ 0.936e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 CHPT1-202ENST00000546490 476 ntTSL 219.04■□□□□ 0.646e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 TSC2-205ENST00000432909 374 ntTSL 318.21■□□□□ 0.516e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.192e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.136e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.12e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.092e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.052e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.012e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 TSC2-206ENST00000439117 5073 ntTSL 1 (best)14.06□□□□□ -0.162e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 D2HGDH-204ENST00000417686 454 ntTSL 513.55□□□□□ -0.246e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.366e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 GLTP-205ENST00000544393 914 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.56e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 CHPT1-206ENST00000550385 754 ntTSL 510.39□□□□□ -0.756e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 GLTP-203ENST00000537066 791 ntTSL 39.56□□□□□ -0.886e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 GLTP-204ENST00000540772 560 ntTSL 59.31□□□□□ -0.926e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 GLTP-202ENST00000536390 583 ntTSL 39.1□□□□□ -0.956e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 CELF1-207ENST00000524648 393 ntTSL 29.04□□□□□ -0.966e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 GLTP-206ENST00000617457 969 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.976e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 CHPT1-208ENST00000552215 4342 ntTSL 1 (best)7.92□□□□□ -1.146e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 CELF1-215ENST00000532048 3044 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.196e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 CELF1-220ENST00000539455 800 ntTSL 55.19□□□□□ -1.586e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.828e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 SUB1-212ENST00000513013 493 ntTSL 53.43□□□□□ -1.868e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.948e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 POLD1-204ENST00000593981 873 ntTSL 519.98■□□□□ 0.793e-9■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 POLD1-208ENST00000596648 1048 ntTSL 519.01■□□□□ 0.633e-9■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 POLD1-202ENST00000593407 867 ntTSL 518.76■□□□□ 0.593e-9■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.453e-9■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.433e-9■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 POLD1-212ENST00000600859 3474 ntTSL 212.03□□□□□ -0.483e-9■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.53e-9■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.533e-9■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.533e-9■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.277e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 SSH1-208ENST00000548522 602 ntTSL 316.78■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.452e-6■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 MAGI3-206ENST00000486456 897 ntTSL 520.19■□□□□ 0.828e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.38e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.198e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.168e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.378e-8■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 27.1
HNRNPKP61978 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.234e-6■■■■■ 27
HNRNPKP61978 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.64e-6■■■■■ 27
HNRNPKP61978 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.014e-6■■■■■ 27
HNRNPKP61978 C6orf89-202ENST00000359359 2565 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.114e-6■■■■■ 27
HNRNPKP61978 DHCR7-206ENST00000527316 1005 ntTSL 521.8■■□□□ 1.081e-7■■■■■ 27
HNRNPKP61978 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.051e-7■■■■■ 27
HNRNPKP61978 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 27
HNRNPKP61978 DHCR7-211ENST00000534701 456 ntTSL 311□□□□□ -0.651e-7■■■■■ 27
HNRNPKP61978 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.93e-6■■■■■ 27
HNRNPKP61978 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.883e-6■■■■■ 27
HNRNPKP61978 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.883e-6■■■■■ 27
HNRNPKP61978 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.843e-6■■■■■ 27
HNRNPKP61978 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.793e-6■■■■■ 27
HNRNPKP61978 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.783e-6■■■■■ 27
HNRNPKP61978 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 27
HNRNPKP61978 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.753e-6■■■■■ 27
HNRNPKP61978 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 27
HNRNPKP61978 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 27
HNRNPKP61978 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 27
HNRNPKP61978 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.737e-25■■■■■ 27
HNRNPKP61978 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.477e-25■■■■■ 27
HNRNPKP61978 FARP1-202ENST00000376581 1021 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.035e-9■■■■■ 27
HNRNPKP61978 ERBB3-214ENST00000550070 2729 ntTSL 1 (best)9.32□□□□□ -0.922e-9■■■■■ 27
HNRNPKP61978 ERBB3-221ENST00000553131 3237 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.172e-9■■■■■ 27
HNRNPKP61978 ACSF2-218ENST00000510410 1745 ntTSL 223.13■■□□□ 1.293e-8■■■■■ 27
HNRNPKP61978 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.823e-8■■■■■ 27
HNRNPKP61978 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.83e-8■■■■■ 27
HNRNPKP61978 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.183e-8■■■■■ 27
HNRNPKP61978 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.093e-8■■■■■ 27
HNRNPKP61978 ACSF2-223ENST00000513101 564 ntTSL 48.72□□□□□ -1.013e-8■■■■■ 27
HNRNPKP61978 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.091e-15■■■■■ 27
HNRNPKP61978 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.211e-15■■■■■ 27
HNRNPKP61978 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.348e-9■■■■■ 27
HNRNPKP61978 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.618e-9■■■■■ 27
HNRNPKP61978 MEGF8-203ENST00000378073 11034 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.78e-9■■■■■ 27
HNRNPKP61978 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.894e-9■■■■■ 27
HNRNPKP61978 LTB4R-204ENST00000553481 431 ntTSL 214.17□□□□□ -0.144e-9■■■■■ 27
HNRNPKP61978 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.341e-6■■■■■ 26.9
HNRNPKP61978 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.151e-6■■■■■ 26.9
HNRNPKP61978 RABL6-210ENST00000484471 2746 ntTSL 517.3■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 26.9
HNRNPKP61978 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 26.9
HNRNPKP61978 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 26.9
HNRNPKP61978 RABL6-208ENST00000464941 3361 ntTSL 215.22■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 26.9
HNRNPKP61978 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 26.9
HNRNPKP61978 RABL6-206ENST00000436380 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 213.13□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 26.9
HNRNPKP61978 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.019e-7■■■■■ 26.9
HNRNPKP61978 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.079e-7■■■■■ 26.9
HNRNPKP61978 ERBB3-216ENST00000550869 572 ntTSL 411.76□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 26.9
Retrieved 100 of 15,354 protein–RNA pairs in 224.3 ms