Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AIF1P55008 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AIF1P55008 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AIF1P55008 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AIF1P55008 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AIF1P55008 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
AIF1P55008 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AIF1P55008 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AIF1P55008 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AIF1P55008 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AIF1P55008 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AIF1P55008 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
AIF1P55008 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AIF1P55008 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AIF1P55008 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AIF1P55008 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AIF1P55008 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AIF1P55008 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AIF1P55008 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AIF1P55008 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AIF1P55008 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AIF1P55008 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
AIF1P55008 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AIF1P55008 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AIF1P55008 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AIF1P55008 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
AIF1P55008 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AIF1P55008 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AIF1P55008 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AIF1P55008 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AIF1P55008 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AIF1P55008 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AIF1P55008 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AIF1P55008 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AIF1P55008 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AIF1P55008 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AIF1P55008 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AIF1P55008 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AIF1P55008 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AIF1P55008 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AIF1P55008 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AIF1P55008 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AIF1P55008 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AIF1P55008 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AIF1P55008 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AIF1P55008 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AIF1P55008 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AIF1P55008 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AIF1P55008 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AIF1P55008 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AIF1P55008 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AIF1P55008 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AIF1P55008 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AIF1P55008 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AIF1P55008 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AIF1P55008 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AIF1P55008 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AIF1P55008 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AIF1P55008 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AIF1P55008 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AIF1P55008 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AIF1P55008 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AIF1P55008 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AIF1P55008 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AIF1P55008 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AIF1P55008 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AIF1P55008 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AIF1P55008 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AIF1P55008 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AIF1P55008 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AIF1P55008 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AIF1P55008 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AIF1P55008 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AIF1P55008 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AIF1P55008 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AIF1P55008 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AIF1P55008 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AIF1P55008 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AIF1P55008 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AIF1P55008 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AIF1P55008 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AIF1P55008 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AIF1P55008 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AIF1P55008 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AIF1P55008 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AIF1P55008 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AIF1P55008 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AIF1P55008 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AIF1P55008 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AIF1P55008 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AIF1P55008 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AIF1P55008 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AIF1P55008 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AIF1P55008 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AIF1P55008 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AIF1P55008 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AIF1P55008 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AIF1P55008 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AIF1P55008 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AIF1P55008 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms