Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGGT1BP53609 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGGT1BP53609 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGGT1BP53609 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
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