Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
KPNA2P52292 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KPNA2P52292 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms