Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPC3P51654 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GPC3P51654 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPC3P51654 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPC3P51654 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPC3P51654 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GPC3P51654 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GPC3P51654 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPC3P51654 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC3P51654 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC3P51654 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC3P51654 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC3P51654 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC3P51654 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC3P51654 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC3P51654 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC3P51654 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC3P51654 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC3P51654 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC3P51654 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC3P51654 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC3P51654 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPC3P51654 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPC3P51654 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPC3P51654 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPC3P51654 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPC3P51654 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPC3P51654 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPC3P51654 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPC3P51654 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPC3P51654 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GPC3P51654 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC3P51654 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC3P51654 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC3P51654 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC3P51654 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC3P51654 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC3P51654 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GPC3P51654 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC3P51654 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC3P51654 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC3P51654 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC3P51654 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC3P51654 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC3P51654 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC3P51654 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC3P51654 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC3P51654 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPC3P51654 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPC3P51654 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPC3P51654 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPC3P51654 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC3P51654 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC3P51654 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC3P51654 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC3P51654 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC3P51654 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC3P51654 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC3P51654 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC3P51654 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC3P51654 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC3P51654 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC3P51654 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC3P51654 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC3P51654 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC3P51654 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC3P51654 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC3P51654 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC3P51654 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC3P51654 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GPC3P51654 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPC3P51654 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPC3P51654 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPC3P51654 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPC3P51654 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPC3P51654 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPC3P51654 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPC3P51654 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPC3P51654 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPC3P51654 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPC3P51654 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC3P51654 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC3P51654 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC3P51654 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC3P51654 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC3P51654 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC3P51654 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC3P51654 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC3P51654 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC3P51654 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC3P51654 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC3P51654 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC3P51654 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC3P51654 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC3P51654 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC3P51654 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC3P51654 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC3P51654 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC3P51654 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC3P51654 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms