Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSRP3P50461 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSRP3P50461 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms