Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EIF4A3P38919 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF4A3P38919 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms