Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC1P33527 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC1P33527 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC1P33527 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC1P33527 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC1P33527 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC1P33527 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC1P33527 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC1P33527 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC1P33527 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC1P33527 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC1P33527 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
ABCC1P33527 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
ABCC1P33527 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ABCC1P33527 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ABCC1P33527 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ABCC1P33527 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
ABCC1P33527 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
ABCC1P33527 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
ABCC1P33527 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
ABCC1P33527 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ABCC1P33527 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ABCC1P33527 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ABCC1P33527 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ABCC1P33527 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ABCC1P33527 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms