Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF2E1P29083 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF2E1P29083 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF2E1P29083 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms