Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP1P28562 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP1P28562 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP1P28562 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP1P28562 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP1P28562 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP1P28562 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP1P28562 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP1P28562 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP1P28562 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP1P28562 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP1P28562 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP1P28562 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP1P28562 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DUSP1P28562 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DUSP1P28562 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms