Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNA1P20827 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA1P20827 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA1P20827 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms