Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RXRAP19793 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RXRAP19793 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RXRAP19793 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RXRAP19793 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RXRAP19793 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RXRAP19793 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RXRAP19793 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RXRAP19793 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RXRAP19793 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RXRAP19793 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RXRAP19793 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RXRAP19793 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RXRAP19793 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RXRAP19793 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RXRAP19793 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RXRAP19793 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RXRAP19793 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RXRAP19793 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RXRAP19793 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RXRAP19793 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RXRAP19793 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RXRAP19793 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RXRAP19793 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RXRAP19793 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RXRAP19793 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RXRAP19793 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RXRAP19793 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RXRAP19793 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RXRAP19793 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RXRAP19793 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RXRAP19793 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RXRAP19793 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RXRAP19793 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RXRAP19793 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RXRAP19793 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RXRAP19793 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RXRAP19793 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RXRAP19793 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RXRAP19793 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RXRAP19793 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RXRAP19793 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RXRAP19793 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RXRAP19793 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RXRAP19793 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RXRAP19793 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RXRAP19793 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RXRAP19793 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RXRAP19793 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RXRAP19793 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RXRAP19793 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RXRAP19793 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RXRAP19793 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RXRAP19793 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RXRAP19793 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RXRAP19793 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RXRAP19793 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RXRAP19793 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RXRAP19793 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RXRAP19793 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RXRAP19793 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RXRAP19793 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RXRAP19793 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RXRAP19793 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RXRAP19793 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RXRAP19793 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RXRAP19793 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RXRAP19793 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RXRAP19793 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RXRAP19793 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RXRAP19793 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RXRAP19793 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RXRAP19793 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RXRAP19793 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RXRAP19793 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RXRAP19793 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RXRAP19793 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RXRAP19793 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RXRAP19793 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RXRAP19793 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RXRAP19793 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RXRAP19793 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RXRAP19793 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RXRAP19793 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RXRAP19793 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RXRAP19793 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RXRAP19793 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RXRAP19793 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RXRAP19793 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RXRAP19793 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RXRAP19793 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RXRAP19793 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RXRAP19793 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RXRAP19793 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RXRAP19793 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RXRAP19793 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RXRAP19793 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RXRAP19793 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RXRAP19793 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RXRAP19793 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms