Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM1P13164 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms