Protein–RNA interactions for Protein: P01717

IGLV3-25, Immunoglobulin lambda variable 3-25, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGLV3-25P01717 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGLV3-25P01717 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGLV3-25P01717 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGLV3-25P01717 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGLV3-25P01717 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
IGLV3-25P01717 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
IGLV3-25P01717 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGLV3-25P01717 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGLV3-25P01717 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGLV3-25P01717 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGLV3-25P01717 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGLV3-25P01717 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGLV3-25P01717 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGLV3-25P01717 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGLV3-25P01717 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGLV3-25P01717 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGLV3-25P01717 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGLV3-25P01717 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGLV3-25P01717 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGLV3-25P01717 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGLV3-25P01717 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGLV3-25P01717 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGLV3-25P01717 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGLV3-25P01717 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGLV3-25P01717 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms