Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSO75390 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSO75390 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSO75390 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSO75390 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSO75390 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSO75390 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSO75390 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSO75390 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSO75390 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CSO75390 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSO75390 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSO75390 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSO75390 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSO75390 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSO75390 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CSO75390 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CSO75390 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSO75390 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSO75390 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSO75390 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSO75390 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSO75390 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSO75390 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSO75390 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSO75390 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSO75390 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSO75390 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSO75390 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSO75390 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSO75390 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSO75390 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSO75390 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSO75390 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSO75390 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSO75390 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSO75390 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSO75390 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSO75390 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSO75390 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSO75390 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSO75390 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSO75390 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSO75390 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSO75390 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSO75390 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSO75390 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSO75390 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSO75390 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSO75390 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSO75390 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSO75390 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSO75390 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSO75390 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSO75390 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSO75390 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSO75390 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSO75390 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSO75390 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSO75390 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSO75390 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CSO75390 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSO75390 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSO75390 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSO75390 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSO75390 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSO75390 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSO75390 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSO75390 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSO75390 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSO75390 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSO75390 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSO75390 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSO75390 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSO75390 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSO75390 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSO75390 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CSO75390 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CSO75390 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSO75390 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSO75390 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSO75390 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSO75390 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSO75390 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CSO75390 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSO75390 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSO75390 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSO75390 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSO75390 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSO75390 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSO75390 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSO75390 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSO75390 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSO75390 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSO75390 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSO75390 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSO75390 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSO75390 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSO75390 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSO75390 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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