Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
IGSF3O75054 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IGSF3O75054 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms