Protein–RNA interactions for Protein: O15533

TAPBP, Tapasin, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBPO15533 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TAPBPO15533 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms