Protein–RNA interactions for Protein: D6RGX4

FAM90A26, Family with sequence similarity 90 member A26, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A26D6RGX4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM90A26D6RGX4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FAM90A26D6RGX4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM90A26D6RGX4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM90A26D6RGX4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM90A26D6RGX4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM90A26D6RGX4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM90A26D6RGX4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM90A26D6RGX4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM90A26D6RGX4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM90A26D6RGX4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM90A26D6RGX4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM90A26D6RGX4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM90A26D6RGX4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM90A26D6RGX4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM90A26D6RGX4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM90A26D6RGX4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM90A26D6RGX4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM90A26D6RGX4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM90A26D6RGX4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM90A26D6RGX4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM90A26D6RGX4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM90A26D6RGX4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM90A26D6RGX4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms