Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ARID3CA6NKF2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ARID3CA6NKF2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ARID3CA6NKF2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ARID3CA6NKF2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ARID3CA6NKF2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ARID3CA6NKF2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ARID3CA6NKF2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ARID3CA6NKF2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARID3CA6NKF2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARID3CA6NKF2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARID3CA6NKF2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARID3CA6NKF2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
ARID3CA6NKF2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARID3CA6NKF2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARID3CA6NKF2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ARID3CA6NKF2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ARID3CA6NKF2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ARID3CA6NKF2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ARID3CA6NKF2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ARID3CA6NKF2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ARID3CA6NKF2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ARID3CA6NKF2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
ARID3CA6NKF2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ARID3CA6NKF2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ARID3CA6NKF2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.1 ms