Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X179

TBC1D3E, TBC1 domain family member 3E, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TBC1D3EA0A087X179 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBC1D3EA0A087X179 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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TBC1D3EA0A087X179 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBC1D3EA0A087X179 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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TBC1D3EA0A087X179 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBC1D3EA0A087X179 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBC1D3EA0A087X179 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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TBC1D3EA0A087X179 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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TBC1D3EA0A087X179 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBC1D3EA0A087X179 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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TBC1D3EA0A087X179 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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TBC1D3EA0A087X179 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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TBC1D3EA0A087X179 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBC1D3EA0A087X179 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBC1D3EA0A087X179 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TBC1D3EA0A087X179 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBC1D3EA0A087X179 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBC1D3EA0A087X179 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBC1D3EA0A087X179 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBC1D3EA0A087X179 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBC1D3EA0A087X179 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBC1D3EA0A087X179 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBC1D3EA0A087X179 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBC1D3EA0A087X179 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBC1D3EA0A087X179 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBC1D3EA0A087X179 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBC1D3EA0A087X179 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBC1D3EA0A087X179 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBC1D3EA0A087X179 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBC1D3EA0A087X179 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBC1D3EA0A087X179 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBC1D3EA0A087X179 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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