Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0B3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0B3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A087X0B3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A087X0B3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A087X0B3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A087X0B3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A087X0B3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A087X0B3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
A0A087X0B3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms