Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CAPN7Q9Y6W3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN7Q9Y6W3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms