Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARFGEF2Q9Y6D5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARFGEF2Q9Y6D5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ARFGEF2Q9Y6D5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARFGEF2Q9Y6D5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms