Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
COG6Q9Y2V7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COG6Q9Y2V7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms