Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD4AQ9UPU9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD4AQ9UPU9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms