Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHA12Q9UN75 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHA12Q9UN75 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHA12Q9UN75 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms