Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PARP4Q9UKK3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PARP4Q9UKK3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PARP4Q9UKK3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms